藏语称“赛尔顿”。 位于全寺正中,背靠西岭倚山而起,高19米,铜瓦金顶宝瓶、法幢喷焰泛光,灿灿耀目,为塔尔寺最早的建筑物。面积近450平方米,是塔尔寺的主殿。汉式宫殿三檐歇山式建筑,雄伟壮观。相传藏传佛教格鲁派(黄教)创始人宗喀巴出生时,其母将胞衣埋在大金瓦寺正中即现在的大银塔地下,后来这里长出一株菩提树,长有10万片叶子,每片叶子上现出狮子吼佛像一尊,其母本着敬爱之心,在此建立一座小塔,后人在小塔的基础上建起了高11米的大银塔,并将以后形成的寺院命名为塔尔寺。大金瓦寺两侧各有弥勒佛殿一座,右殿(上贤康)系明万历五年(1577年)建,左殿(下贤康)系万历二十二年所建。
大殿正门顶悬“护国保民”大红漆匾,北边门供拜佛念经者出入。大殿中央高竖宗喀巴纪念塔(菩提大灵塔),塔高11米,塔身高矗,塔尖通大殿天井直达三楼顶,灵塔以纯银作底,塔身缀满了宝石珍珠、玛瑙翡翠,珍贵而又神秘。
大金瓦殿凭临山坡,左右前面有弥勒殿、释加殿、依怙殿,高低错落,色彩风格各异,更显出大金瓦殿突兀拔群,超然挺立的丰姿。